Конкретное изменение в шиповидном белке означает, что вирус Covid распространяется быстрее, чем когда-либо. Появилась новая, более заразная форма нового коронавируса. У него больше возможностей уклоняться от антител человека. И распространяется легче, чем когда-либо.
Многие люди уже читали эти слова раньше и почти наверняка прочтут их снова ни один раз, поскольку пандемия Covid продолжается уже четвёртый календарный год. Но на этот конкретный вирус XBB.1.5, также известный как Kraken нужно обратить особое внимание, потому что в нём есть что-то новое. На данный момент это последний подвариант Omicron, который быстро становится доминирующей формой SARS-CoV-2 в большей части мира.
XBB.1.5 развился после пары больших генетических поворотов. Вирус всё ещё может удивить человечество. И это может означать только одно: «Похоже, что SARS-CoV-2 будет с нами ещё долго», — говорит Мэтью Фриман, иммунолог и микробиолог из Медицинской школы Университета Мэриленда. Кракен имеет ключевую мутацию, которую генетики называют «F486P». Это, казалось бы, небольшое изменение в шиповидном белке, той части вируса, которая помогает ему захватывать и заражать клетки живого организма. F486P работает, повышая способность шипа «связываться» с одной конкретной частью наших клеток, называемой рецептором ACE2. Это небольшое изменение имеет огромное значение. F486P позволяет XBB.1.5 сохранить все наиболее опасные качества своих родительских подвариантов, а также добавить новое качество: экстремальную заразность.
По сути, F486P делает XBB.1.5 действительно очень заразным — гораздо более заразным, чем его непосредственные предшественники. Но он также унаследовал от тех же предшественников тревожную способность уклоняться от антител человека. «Из-за шиповой мутации F486P XBB.1.5 демонстрирует значительно более высокую аффинность к связыванию с вирусными рецепторами… при этом он сохраняет аналогичные свойства уклонения от антител», — говорит Лихонг Лю, исследователь Covid Covid из Колумбийского университета.
Короче говоря, XBB.1.5 является первым подвариантом в своём ближайшем семействе, который одновременно более уклончив от иммунитета и более заразен.
Появление мутации F486P является напоминанием о том, что, несмотря на то, что многие люди продолжают жить своей жизнью, пандемия ещё далеко не закончилась. Вирус продолжает находить способы распространяться быстрее, а также всё чаще проникать сквозь все те антитела, которые создавались организмом в результате вакцин, бустеров и предшествующего инфицирования.
XBB.1.5 впервые был обнаружен в образцах вируса на северо-востоке США ещё в октябре. Два месяца спустя он присутствует почти в 30 странах и, согласно последним прогнозам Центров по контролю и профилактике заболеваний США, уже может быть доминирующей формой Covid в Соединенных Штатах. Не случайно произошёл всплеск серьёзных случаев Covid на северо-востоке США, где родился XBB.1.5 и в регионе, где его наибольшая концентрация в воздухе.
Фото: politico.eu
Конечно же, человечество уже проходило через подобное. Какой-то новый подвариант развивается, становится доминирующим и вызывает всплеск случаев. Но к настоящему времени у большинства людей в большинстве стран есть здоровая смесь антител к Covid от вакцин, перенесённой инфекции или того и другого. Таким образом, в то время как уровень инфицирования растёт и падает в соответствии с ритмом эволюции вируса, госпитализация и смертность имеют тенденцию к снижению в большинстве стран мира уже много месяцев. Нет оснований ожидать, что XBB.1.5 существенно изменит эту динамику. Несмотря на все новые генетические недостатки, это всё ещё Омикрон. И помимо вакцин, бустеров и иммунитета от прошлой инфекции у нас есть много способов защититься от этого конкретного варианта и его потомства.
Если есть большое исключение, то это Китай, где три года блокировки наконец начали сниматься в начале декабря после массовых протестов общественности. Теперь китайская система здравоохранения страдает от первой крупной общенациональной вспышки Covid в стране. Примечательно, что XBB.1.5 не появился в Китае. Ещё.
Большая часть мира находится в довольно хорошем положении, чтобы справиться с XBB.1.5. Но у Китая нет такой возможности. Для многих сотен миллионов китайцев с более слабым иммунитетом эволюционные перипетии COVID выглядят довольно зловеще. Всё началось с BA.2 и BA.2.75, двух ранних подвариантов Омикрона, которые доминировали во многих странах прошлой весной и летом соответственно. В какой-то момент кто-то — или несколько человек — выздоровевшие от BA.2 подхватили BA.2.75 или наоборот. Две формы вируса объединились в этих хозяевах, продуцируя «рекомбинантный» XBB, который позже превратился в XBB.1, а затем в XBB.1.5.
Питер Хотез, эксперт по разработке вакцин из Бэйлорского колледжа, описывает эти рекомбинанты как варианты «Scrabble». «Потому что они, как правило, используют ценные буквы Scrabble, такие как X, B и Q». Общим для всех них является то, что они являются «ускользающими вариантами рецептор-связывающего домена», — говорит Хотез.
Говоря простым языком, у них есть липкие шиповидные белки, и они очень хорошо уворачиваются от человеческихантител, особенно антител, которые люди получают от вакцин. «Насколько я понимаю, XBB.1, родитель XBB.1.5, почти полностью устойчив к индуцированному вакциной гуморальному иммунитету», — говорит Кей Сато, вирусолог из Токийского университета. Но XBB.1.5 ещё более липкий и уклончивый. А всё из-за мутации F486P.
Оригинальный XBB и его ближайший потомок XBB.1 включали F486S, а не F486P. F486S изменил шиповидный белок, но не сделал его более липким и, следовательно, более трансмиссивным. С F486P XBB и XBB.1 достигли большего уклонения от иммунитета без увеличения трансмиссивности. Затем появился XBB.1.5 и нарушил эту утешительную тенденцию. Обновление мутации с F486S до F486P сделало шиповидный белок более липким, а вирус более трансмиссивным.
Фото: smh.com.au
Для большинства из нас это генетическое новшество больше всего беспокоит тенденцией, о которой оно сигнализирует. В начале 2021 года — всего через шесть месяцев после начала пандемии — были некоторые предположения, что SARS-CoV-2, так сказать, исчерпает генетическое пространство и прекратит существенные мутации. Этого не произошло. «Кажется, в геноме ещё больше места для мутаций», — говорит Фриман.
XBB.1.5 является доказательством того, что вирус всё ещё может меняться, становиться более заразным и уклончивым. Он может, спустя столько времени, всё ещё удивлять учёных.