Единственный сын
Бориса Годунова,
Фёдор (первой была дочь
Ксения), родился в Москве в 1589 году. Так как Борис поддерживал многие связи за границей, Фёдора с ранних лет воспитывали иностранные учителя, специально приглашённые его отцом в Москву. Перед самой смертью Годунова его сын неоднократно поражал двор своей рассудительностью, проницательностью и эрудицией.
Когда Фёдор Борисович был ещё царевичем, он даже вошёл в историю отечественной картографии. Первая карта России была создана под его руководством.
Раньше существовали лишь прототипы карт русских территорий, сделанные иностранными картографами. Карта, созданная царевичем Фёдором, была напечатана в 1613 году в Амстердаме.
Борис рано начал знакомить горячо любимого сына с государственными делами. Когда Фёдору было восемь лет, он взял его на первый большой приём, а позже царевич присутствовал на всех заседаниях отца и принимал с ним иностранных послов.
После смерти Бориса Фёдор в возрасте шестнадцати лет в присутствии матери и старшей сестры принял присягу наследника престола, а подданные присягнули ему на верность, так как отец позаботился о том, чтобы окружить сына влиятельными друзьями. Это было 13 апреля 1605 года, а 1 июня Фёдор, его мать Мария и сестра Ксения были арестованы в Кремле сторонниками Лжедмитрия. Многие из тех бояр, которые поддерживали Бориса Годунова, отказались поддержать неопытного мальчика. Они предпочли встать на сторону Лжедмитрия, идущего в то время на Москву со своим войском.
Под именем Дмитрий I лжецарь взошёл на престол с согласия боярского правительства, незадолго до этого Фёдор и его мать были задушены в их кремлёвских покоях. По некоторым данным, Лжедмитрий поставил условием убийство Годуновых своего въезда в Москву. Убийц было четверо, очевидно, Фёдор отчаянно пытался защитить себя и мать, будучи сильным юношей.
Народу было объявлено, что царь Фёдор с матерью покончили жизнь самоубийством, отравившись. Их тела были выставлены на всеобщее обозрение, но на них, по свидетельствам очевидцев, угадывались следы борьбы. С сестрой Фёдора, Ксенией, Лжедмитрий обошёлся жестоко, но оставил её в живых, отправив в монастырь.